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窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析 | |
段义忠; 张得钧; 高庆波; 张发起; 李印虎; 陈世龙 | |
2010-04-15 | |
发表期刊 | 植物研究 |
ISSN | 1673-5102 |
卷号 | 30期号:2页码:146-151 |
摘要 | 应用PCR产物直接测序法分析了窄叶鲜卑花居群间nrDNA (核糖体DNA) ITS序列和cpDNA (叶绿体DNA) trnL-F的碱基差异,并与cpDNA trnS-G序列和rpl20-rps12序列进行比较,从而初步研究两套植物基因组的变异速率。采用改良的CTAB法从硅胶干燥的窄叶鲜卑花叶片中提取总DNA,并对nrDNA ITS和cpDNA trnL-F区域进行扩增、纯化、测序。nrDNA ITS序列共有601 bp,有变异位点3处,变异位点百分率为0. 05% , ( G + C)含量为41. 4%。cpDNA trnL-F序列共有927 bp,有变异位点1处,变异位点百分率0. 01% , (G +C)含量为32. 6% ,两种序列的核苷酸多样性非常低。比较发现,窄叶鲜卑花nrDNA ITS区域较cpDNA trnS-G序列和rpl20-rps12序列保守,变异速率较慢,比cpDNA trnL-F序列变异速率稍快。通过对ITS序列单倍型( haplotype)进行分析发现,窄叶鲜卑花现有分布范围经历了居群近期范围扩张,与叶绿体基因组( trnS-G和rpl20-rps12序列)得出的结论一致。因此,窄叶鲜卑花nrDNA ITS序列适合该种的谱系地理学研究。 |
收录类别 | CSCD |
CSCD记录号 | CSCD:3835857 |
引用统计 | |
文献类型 | 期刊论文 |
条目标识符 | http://210.75.249.4/handle/363003/2974 |
专题 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 段义忠,张得钧,高庆波,等. 窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析[J]. 植物研究,2010,30(2):146-151. |
APA | 段义忠,张得钧,高庆波,张发起,李印虎,&陈世龙.(2010).窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析.植物研究,30(2),146-151. |
MLA | 段义忠,et al."窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata) nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析".植物研究 30.2(2010):146-151. |
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